Gruber hatte von 1963 bis 1992 den Lehrstuhl für Dogmatik inne, war in den Jahren 1963/64 bzw. 1971/72 Dekan der Fakultät und im STJ 1972/73 Rektor der Karl-Franzens-Universität Graz. Er setzte entscheidende Akzente im Bereich der Ökumene, die heute noch die theologische Fakultät auszeichnen.